W gablotach Málaga Club de Fútbol próżno szukać znaczących trofeów. Zarówno pod obecną nazwą, pod którą klub występuje od 1994 roku (referendum w 1993), jak i pod poprzednią CD Málaga, za sukces można uznać wygranie Segunda Division lub wywalczenie kilku trofeów towarzyskich. Mamy jednak nadzieję, że wraz z przyjściem bogatego właściciela szybko się to zmieni. Poniżej zaprezentowany jest wyłącznie dorobek Malaga CF, od sezonu 1998/1999, kiedy to Boquerones po zaledwie roku gry w Secudna Division awansowali do Primera Division. Wcześniej występowali w na niższym szczeblu rozgrywkowym.

Primera Division:

- sezon 2010/2011 – 11. miejsce

- sezon 2009/2010 – 17. miejsce

- sezon 2008/2009 – 8. miejsce

- sezon 2005/2006 – 20. miejsce (spadek do SD)

- sezon 2004/2005 – 10. miejsce

- sezon 2003/2004 – 10. miejsce

- sezon 2002/2003 – 14. miejsce

- sezon 2001/2002 – 9. miejsce

- sezon 2000/2001 – 8. miejsce

- sezon 1999/2000 – 12. miejsce

Secunda Division:

- sezon 2007/2008 – 2. miejsce (awans do PD)

- sezon 2006/2007 – 16. miejsce

- sezon 1998/1999 – 1. miejsce (awans do PD)

Europejskie Puchary:

- sezon 2002/2003: Malaga poprzez Puchar Intertoto przebiła się do rozgrywek Pucharu UEFA

* I runda:

Željezničar Sarajewo

vs

Málaga CF

0-0

0-1

* II runda:

Málaga CF

vs

Amica Wronki

2-1

2-1

* III runda:

Málaga CF

vs

Leeds United

0-0

2-1

* IV runda:

Málaga CF

vs

AEK Ateny

0-0

1-0

* ćwierćfinał:

Málaga CF

vs

Boavista FC

1-0

k. 1:4 0-1